高速离心机配备了多种类型的转子，以适应不同样品和分离要求，它的离心管在转子中呈一定角度放置，在旋转过程中，样品受到的离心力方向与离心管轴线呈一定夹角。这种设计使得角转子能够在较短时间内达到较高的分离效果，适用于对分离时间要求较高、样品量相对较小的实验，如核酸提取、蛋白质沉淀等。
水平转子则是另一种重要的转子类型。离心管在水平转子中水平放置，旋转时样品受到的离心力方向垂直于离心管轴线。水平转子的特点是分离过程中样品的再悬浮现象较少，能够获得较为清晰的分离界面，特别适合用于密度梯度离心等对分离效果要求较高的实验。
此外，还有一些特殊用途的转子，如区带转子、连续流转子等。区带转子适用于大规模的密度梯度离心，能够在离心管中形成稳定的密度梯度，实现复杂混合物的分离。连续流转子则可以实现样品的连续进样和分离，大大提高了分离效率，适用于工业生产中的大规模分离操作。
